La referencia RTPCR010 no incluye la mutación de Spike E484K para detectar variantes de SARS-CoV-2, ya que esta no ofrece ninguna discriminación adicional de variantes cuando ya se utilizan HV69/70 y N501Y, y además, limitaría en el ensayo a un proceso de dos pasos. Se ha diseñado este test para ser compatible con termocicladores de 4 canales y ser realizado en un solo paso. La mayoría de kits de otras casas comerciales se basan en protocolos de dos pasos, primero detectar SARS-CoV-2 en la muestra, y a continuación, realizar el test de identificación de variantes, lo que incrementa los costes y carga de trabajo.

RTPCR010 toma una aproximación diferente:

- Incluye un control interno (RNAseP humana) y dianas genéricas de SARS-CoV-2 (gen N) que pueden ser usadas para diagnóstico e identificación de variantes en un solo paso.

- El ensayo detecta alteraciones en el residuo salvaje, no una mutación específica, que podrían ser clasificadas como nuevas mutaciones, como K417N/T o E484Q (además de E484K), las cuales podrían no ser detectadas por la estrategia de detección de mutaciones.