Asignación de variantes con CT>36 RTPCR010
Generalmente, si alguno de los valores de Ct para los marcadores del virus (FAM, HEX o Texas/ROX) es superior a 36, el resultado no debe considerarse para la asignación de linaje. Si el target N está en el rango de >36 Ct <40 los resultados deben ser “SARS CoV2 POSITIVO, LINAJE NO DETERMINADO”. Los resultados por debajo de Ct 36 deben considerarse para la asignación de linaje ya sea por el software de interpretación de resultados Vircom o por interpretación manual pero no por encima de Ct 36.
La razón para establecer este umbral es que por encima de Ct 36 la asignación de linaje no es precisa ya que la cantidad de ARN en la muestra es muy baja, y el linaje no pudo ser confirmado por secuenciación debido al escaso ARN.
Related Articles
Formato de tubos RT-PCR
Tanto el formato LP como el LPP utilizan tubos "low profile" opacos blancos que permiten la lectura de fluorescencia desde el ángulo superior, como los que pueden observarse en las siguientes imágenes: Ambos formatos son compatibles con LightCycler ...
No amplificación de N con amplificación de E (RTPCR002)
En el kit RTPCR002, la causa de la falta de amplificación de N, aun presentándose amplificación de E, se debe a una mutación en el ARN del virus en la secuencia diana de la sonda. Recientemente identificamos varias secuencias de SARS-CoV-2 que ...
Mutación E484K (RTPCR010)
La referencia RTPCR010 no incluye la mutación de Spike E484K para detectar variantes de SARS-CoV-2, ya que esta no ofrece ninguna discriminación adicional de variantes cuando ya se utilizan HV69/70 y N501Y, y además, limitaría en el ensayo a un ...
Recomendaciones para PCR
1.- Usar cabinas separadas para el manejo de muestras y controles positivos y en la reconstitución y dispensación del mix. 2.- Uso de puntas con filtro por personal cualificado. 3.- El instrumento de PCR debería estar en un área separada de la zona ...
Interpretación de resultados del kit Vaginal Panel Time PCR (RTPCR005) en VirCom
En archivo adjunto.